MiSeq 个人型测序系统

 

采用illumina边合成边测序技术(SBS),当单个碱基结合DNA链时,通过专利的可逆终止子方法对数百万到数千万个片段进行大规模并行测序。当每个dNTP加入时对荧光标记的终止子成像,随后酶切掉终止子,允许下一个碱基的结合。由于每个测序循环中四种可逆终止子结合的dNTP都存在,所以自然竞争让结合偏差最小化。根据每个循环的信号强度测定检出碱基,与其他技术相比大大降低了原始错误率。

■主要特点:

1)       唯一获得欧洲CE-IVD认证;

2)       唯一在单台设备上整合了扩增、测序和数据分析;

3)       唯一从扩增、测序到数据分析全部自动化;

4)       最精准的数据质量:100%>Q20,70%>Q30;

5)       一次运行可产出15Gb数据,而且仅需两天;

6)       可调整的读长,可选择单端或配对末端序列;

7)       体积小,占地仅0.4平方米,不需要片段化设备。

■全自动的工作流程:扩增、测序、数据分析的一体机

1)       使用Nextera®试剂盒,手工操作仅需15分钟,在1.5小时内完成建库;

2)       在试管内即可完成DNA片段化,不再需要片段化设备;

3)       点击触摸屏,即可开展测序,短至4小时的自动扩增和自动测序;

4)       数据分析从碱基质量打分到变异检出和比对,不到2小时即可自动完成;

5)       即插即用的试剂带有RFID(无线射频识别)追踪;

6)       数据可以上传到BaseSpace®云计算中,随时查询、实时分享、安全性高。

 

■MiSeq系统性能参数

Read Length

Total Time

Output

Reads Passing Filter

Quality Scores (Q30)

1×36 bp

-4 hours

540-610 Mb

12-15 M

>90%

2×25 bp

-5.5 hours

750-850Mb

24-30M

>90%

2×75 bp

-24 hours

3.3-3.8 Gb

44-50M

>85%

2×150 bp

-24 hours

4.5-5.1 Gb

24-30M

>80%

2×250 bp

-39 hours

7.5-8.5 Gb

24-30M

>75%

2×300 bp

-65 hours

13.2-15 Gb

44-50M

>70%

 

■MiSeq的应用

Miseq更为快速和简化的测序流程,可以作为毛细管电泳(CE)测序的成本经济型替代方案。可调的测序读长、可选的测序芯片种类,以及单端或双端测序的选择,都前所未有地为多种实验需求提供了相应数据产量的灵活选择。

1)       靶向重测序 (Targeted Resequencing)
PCR扩增片段测序:基于Nextera的快速文库制备(1.5小时)和36bp测序
高度多重的扩增子测序 (Amplicon Sequencing)
杂交捕获 (Hybrid Capture)
16S宏基因组 (16S Metagenomics)
克隆检验 (Clone Checking)

TruSeq Amplicon-Cancer Panel/ TruSight Tumor

2)       小基因组测序 (Small Genome Sequencing):de novo测序、重测序和质粒测序

3)       RNA测序 (RNA Sequencing):小RNA测序和RNA-seq

4)       文库质控

5)       调控:ChIP-seq

 

本网站由阿里云提供云计算及安全服务 Powered by 安云建站